85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0437 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  34.67 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  30.19 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  29.56 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  32.26 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.64 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  29.61 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  29.68 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.13 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  34.47 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.33 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.96 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  32.12 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.47 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  30.88 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.17 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  29.14 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.72 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.52 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.74 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 331 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  28.48 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  26.49 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  28 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  23.02 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  22.92 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  24.71 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.89 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  24.85 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  23.51 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.63 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  23.51 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  26.63 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  22.7 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  26.06 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.76 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2349  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.5 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  26.29 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  32.76 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2352  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.43 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  19.43 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.62 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.75 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.96 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.13 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.78 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.41 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.41 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.46 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  25.19 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  24.2 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  22.86 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  24.57 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  22.14 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.52 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  25.6 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26.21 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  23.66 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.23 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.05 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.04 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5823  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.53 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.8 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  25.86 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  27.46 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.38 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.78 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  21.43 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  24 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  21.84 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  24 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>