44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4036 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  100 
 
 		 331 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  54.79 
 
 		 330 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  35.57 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  35.28 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  33.33 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  36.9 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  32.82 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  35.08 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  32.4 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  32.08 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  31.67 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  30.25 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  27.44 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  27.73 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.86 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.53 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  27.14 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  23.16 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.17 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.55 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.67 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.03 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.02 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  22.26 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  24.64 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.93 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  30.45 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.22 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.39 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0855  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  22.58 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.79 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  25.2 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.46 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 		 413 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>