83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3902 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  34.67 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  32.43 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.16 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  29.22 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  30.43 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  28.61 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  29.41 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  26.72 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  29.67 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.37 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  29.02 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.39 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.94 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.75 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.37 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  29.28 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.03 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.19 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.72 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.46 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.83 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  29.27 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.72 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  23.37 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  24.16 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.64 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.31 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  22.47 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  24.54 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0855  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  22.33 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.74 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  22.44 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.26 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  23.51 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  26.44 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1285  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.14 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0376066 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.02 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  24.39 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0929  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.27 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520778  normal  0.417573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  26.06 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.72 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  25.76 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1260  NMT1/THI5 like domain protein  22.12 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  22.93 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  22.11 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.26 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.27 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.36 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  26.8 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  23.33 
 
 		 457 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  21.82 
 
 		 331 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.12 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  23.76 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4374  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.18 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  25.16 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1826  phosphonate-binding periplasmic protein  40.54 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0200  hypothetical protein  27.18 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  23.4 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.26 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  21.9 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  25.71 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.06 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.47 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  21.21 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  24.38 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.35 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1221  phosphonate-binding periplasmic protein  34.91 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.32 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  21.6 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2012  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  36.84 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  25.54 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  20.74 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1691  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  36.84 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0796559  normal  0.153582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>