52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1805 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  100 
 
 
334 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  61.76 
 
 
376 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  52.12 
 
 
327 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  47.04 
 
 
322 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  36.19 
 
 
327 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  37.18 
 
 
327 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  36.42 
 
 
330 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  37.95 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  35.97 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  34.46 
 
 
320 aa  155  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  29.68 
 
 
312 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  32.57 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  30.86 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  26.38 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  27.41 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.72 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  27.03 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.68 
 
 
323 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.2 
 
 
306 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.63 
 
 
308 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  22 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26 
 
 
327 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  29.37 
 
 
300 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  24.67 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.51 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.5 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  22.78 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  26.43 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  21.94 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  28.02 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.56 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  29.58 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.58 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  29.58 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3117  NLPA lipoprotein  28.57 
 
 
385 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3780  NLPA lipoprotein  28.14 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.03 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.27 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.24 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  33.96 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.04 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0213  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.13 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.91 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2816  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.19 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000863815 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  23.98 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.54 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  23.98 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.09 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0793  hypothetical protein  24.31 
 
 
332 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>