86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1346 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 327 aa  656    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  55.86 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  49.7 
 
 		 334 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  46.36 
 
 		 376 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  32.69 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  30.16 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  31.07 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  29.97 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  32.4 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  32.26 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  34.3 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  31.46 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  32.45 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  32.65 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  28.28 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.95 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.33 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.1 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  24.84 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  25.48 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  26.04 
 
 		 368 aa  108  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  24.72 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  24.35 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.41 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.83 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.51 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.09 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  22.26 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.67 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.03 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  20.86 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  35.56 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  31.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  37.84 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  26.16 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  26.16 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.16 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.51 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  21.83 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.93 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.96 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.88 
 
 		 385 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  28.11 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0855  twin-arginine translocation pathway signal  22.86 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.63 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  27.33 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.44 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2153  putative solute-binding periplasmic protein of ABC transport  27.5 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.54 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.43 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.11 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.18 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5147  extracellular solute-binding protein family 3  34.69 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  22.82 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.66 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0543  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.91 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.75 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.61 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4507  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.65 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  22.5 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  22.02 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  22.02 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1285  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.43 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0376066 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.17 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  29.69 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1563  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein SsuA  30.37 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 411 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.08 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.43 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  30.85 
 
 		 454 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  22.31 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  27.64 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>