43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0564 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  590  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.87 
 
 
299 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  28.85 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.34 
 
 
300 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  29.55 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.71 
 
 
306 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.14 
 
 
308 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  27.33 
 
 
322 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  27.33 
 
 
322 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  22.92 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  24.07 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.71 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  24.16 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  24.41 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  29.1 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  21.43 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  23.86 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.84 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.22 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  20.34 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  25.43 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  23.05 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  22.1 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.78 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4114  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  26.28 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0996605  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.75 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0427  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.72 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229479  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4140  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  24.82 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  20 
 
 
354 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  21.6 
 
 
334 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  20.72 
 
 
330 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.59 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  17.58 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0855  twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584451  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  21.52 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.31 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  21.38 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.03 
 
 
365 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 
355 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.81 
 
 
358 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  38 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>