63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2281 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
327 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  33.64 
 
 
322 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  34.67 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  31.13 
 
 
312 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  25.75 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.62 
 
 
308 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.99 
 
 
306 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.4 
 
 
331 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  27.64 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  26.48 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.3 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  26 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.83 
 
 
300 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  24.17 
 
 
331 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  23.4 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.1 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  21.82 
 
 
376 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.6 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  23.64 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  25.73 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.16 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.07 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  22.3 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.17 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  24.69 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  24.58 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  22.22 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
340 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  22.96 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.98 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.18 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.46 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
353 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  21.11 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.9 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  25 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  24.24 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  24.24 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  28.87 
 
 
391 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  26.39 
 
 
368 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.53 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  20.1 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.84 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  23.9 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.27 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0212  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.35 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  27.38 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.5 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.73 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  23.57 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4844  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  21.95 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  23.18 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  23.9 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5147  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0576524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.54 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  21.32 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.27 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>