225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0316 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  49.06 
 
 		 384 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2005  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.54 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0215568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  47.17 
 
 		 398 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  43.69 
 
 		 374 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  35.51 
 
 		 344 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  37.21 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  38.82 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  35.35 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  38.38 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  32.71 
 
 		 483 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  34.65 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  43.02 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.86 
 
 		 541 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  35.92 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  37.86 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  31.31 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4322  protein of unknown function DUF182  32 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  34.65 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 372 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  32 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0964  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.71 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3674  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  30.09 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  32.32 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2957  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  32.95 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0473  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0459384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1786  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0365077  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  30.93 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  40.78 
 
 		 526 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  29.89 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  32 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1635  hypothetical protein  31 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272897  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.02 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  37.37 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  34.62 
 
 		 331 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  34.95 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2903  hypothetical protein  29 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.223725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  30.93 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.04 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0502  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  30.19 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.26 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  37.38 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2603  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2838  protein of unknown function DUF182  29.9 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  31.78 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1185  protein of unknown function DUF182  29.9 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.567555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  30.19 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5314  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  34.69 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  30.3 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0987  protein of unknown function DUF182  29.9 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0403063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  31.46 
 
 		 425 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  31.4 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1055  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.115133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  32.35 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  31.13 
 
 		 339 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  32.97 
 
 		 348 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  35.48 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  30.3 
 
 		 398 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  31.31 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.72 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.76 
 
 		 347 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  27.72 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2201  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  31.18 
 
 		 334 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.13 
 
 		 340 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  29.29 
 
 		 379 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  30.84 
 
 		 386 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3470  hypothetical protein  28 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.362357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  41.67 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  30.84 
 
 		 386 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.45 
 
 		 279 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  30.84 
 
 		 386 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  32.04 
 
 		 370 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  32.94 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  26.21 
 
 		 323 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  31 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  38.04 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  36.25 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  29.13 
 
 		 329 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.59 
 
 		 332 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  35.92 
 
 		 337 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33.33 
 
 		 313 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  26.73 
 
 		 323 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5447  hypothetical protein  29.13 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.27292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>