More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4348 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  100 
 
 		 124 aa  249  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  76.07 
 
 		 130 aa  188  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  64.86 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  63.89 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  63.89 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  58.12 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  61.32 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  60 
 
 		 182 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  53.51 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.83 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.83 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  45.83 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  47.75 
 
 		 281 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  44.74 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  44.74 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0479  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.867653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  44.64 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_422  ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000272557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0456  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579396  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  41.07 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  43.86 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  50.5 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  42.86 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  49.5 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  45.54 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  46.36 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  41.07 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>