More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2418 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  87.39 
 
 		 119 aa  216  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  84.87 
 
 		 119 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  85.47 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  85.22 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  77.12 
 
 		 117 aa  190  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  75.63 
 
 		 118 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  46.15 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  46.79 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  40.91 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  47.32 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  45.95 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  43.64 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  42.24 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  40.68 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  40.52 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  40.71 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  39.29 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  37.84 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  36.61 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  43.12 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  41.59 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  38.74 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  43.43 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  41.59 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  40.35 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  40 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  39.47 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  38.18 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  39.09 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  39.09 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  40.18 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  39.82 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  40.19 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>