More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05740 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  78.68 
 
 		 136 aa  223  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  78.52 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  67.86 
 
 		 120 aa  164  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  60.53 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  64.91 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  63.46 
 
 		 182 aa  148  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  61.32 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  59.43 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  51.72 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50.46 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  50 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1495  hypothetical protein  63.93 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  45.16 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  49.49 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  46.46 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  46.15 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  41.88 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  49.5 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  39.84 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  43.93 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  47.47 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  43.8 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.5 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  42.34 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  47.66 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  40 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>