More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5782 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  76.07 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  68.75 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  66.98 
 
 		 182 aa  158  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  66.07 
 
 		 120 aa  156  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  64.55 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  60.53 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  60.53 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 116 aa  143  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  51.26 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  46.15 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 113 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1495  hypothetical protein  69.84 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  44.74 
 
 		 281 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  47.27 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  42.37 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  45.54 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  44.64 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>