More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3138 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 121 aa  234  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  83.61 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  76.86 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  77.31 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  68.6 
 
 		 125 aa  169  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  73.45 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  73.77 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  68.6 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  67.77 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  67.26 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  64.17 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  62.18 
 
 		 117 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  64.29 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  62.93 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  62.28 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  66.07 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1712  50S ribosomal protein L22  71.07 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.935527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  61.4 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  55.46 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  59.66 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  55.12 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  56.78 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0259  ribosomal protein L22  69.42 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  63.48 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  57.98 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  60 
 
 		 281 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  61.26 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  54.31 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  54.62 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  55.46 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  61.67 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  61.4 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  52.54 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  52.54 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  55.75 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  55.26 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  51.69 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  57.52 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  53.78 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  50.42 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  53.85 
 
 		 113 aa  119  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  54.39 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  58.12 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  57.89 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  52.17 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  51.75 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  52.17 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  52.17 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  53.04 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  53.39 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  51.26 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  54.7 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  56.3 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  51.3 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  48.31 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  46.61 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  45.76 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  48.28 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  54.39 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  52.17 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  48.72 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  55.36 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  46.09 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  55.75 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>