More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0847 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  100 
 
 
119 aa  228  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  50.41 
 
 
122 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  51.82 
 
 
110 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  48.74 
 
 
121 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
113 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  46.09 
 
 
117 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  50 
 
 
113 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  53.15 
 
 
114 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  47.9 
 
 
121 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  45.54 
 
 
130 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
114 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  45.95 
 
 
113 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  52.29 
 
 
118 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.05 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  46.09 
 
 
118 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  43.7 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  45.76 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  46.85 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  45.69 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  53.57 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  49.14 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  48.28 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  46.9 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 
118 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 
113 aa  93.6  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  45.38 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  47.46 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  46.02 
 
 
122 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  46.61 
 
 
159 aa  92  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  47.47 
 
 
182 aa  92  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  46.55 
 
 
121 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 
119 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.38 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.38 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
158 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  43.97 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0772  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.151637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  44.54 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 
110 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  48.65 
 
 
212 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 
111 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 
111 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  40.38 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  40.38 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  40.38 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  43.59 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 
120 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  43.86 
 
 
113 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 
112 aa  87  8e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  47.37 
 
 
112 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 
120 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  43.64 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  44.74 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  41.23 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  42.86 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 
149 aa  84  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0482  ribosomal protein L22  36.84 
 
 
117 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  44.04 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  38.98 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  44.54 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  47.27 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>