More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0958 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  80.85 
 
 
147 aa  238  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  72.34 
 
 
159 aa  214  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  71.63 
 
 
159 aa  214  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  68.42 
 
 
149 aa  185  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  60 
 
 
111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  52.29 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 
115 aa  124  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
113 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  54.55 
 
 
120 aa  123  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  58.49 
 
 
116 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  57.27 
 
 
113 aa  123  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  49.25 
 
 
139 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  52.78 
 
 
118 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 
114 aa  120  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  49.58 
 
 
120 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
115 aa  119  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  54.55 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  54.55 
 
 
115 aa  118  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  52.73 
 
 
113 aa  117  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  54.55 
 
 
110 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  58.82 
 
 
127 aa  116  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  53.57 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  51.35 
 
 
112 aa  114  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  49.09 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
113 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 
111 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 
111 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  48.25 
 
 
136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  50.91 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  49.57 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  54.37 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  54.37 
 
 
110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  47.54 
 
 
165 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  52.43 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 
158 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
117 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
117 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  47.5 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
117 aa  110  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  47.41 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  45.22 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  45.69 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  51.82 
 
 
113 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 
113 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
110 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  50.47 
 
 
110 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  51.46 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>