More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3753 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  100 
 
 
136 aa  272  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  75.81 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  65.12 
 
 
158 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  70.18 
 
 
140 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  69.57 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  73.33 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  67.74 
 
 
125 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  60.8 
 
 
139 aa  158  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  69.75 
 
 
117 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  70.49 
 
 
155 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  71.17 
 
 
142 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  76.92 
 
 
122 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  70.19 
 
 
152 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  70.19 
 
 
152 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  69.75 
 
 
197 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  60 
 
 
158 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  66.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  68.55 
 
 
177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  68.55 
 
 
177 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 
121 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  68.55 
 
 
177 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  64.96 
 
 
121 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  73.08 
 
 
125 aa  147  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  61.29 
 
 
125 aa  147  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  64.86 
 
 
117 aa  147  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  68.52 
 
 
125 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  68.29 
 
 
141 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  62.18 
 
 
121 aa  147  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  59.69 
 
 
281 aa  146  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  67.57 
 
 
122 aa  144  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  61.47 
 
 
119 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  63.25 
 
 
122 aa  140  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  61.29 
 
 
123 aa  139  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  60.48 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  60.53 
 
 
120 aa  138  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  58.77 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 
119 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  58.56 
 
 
119 aa  136  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  64.49 
 
 
111 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  59.65 
 
 
120 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  60.38 
 
 
120 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  60.38 
 
 
120 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  55.26 
 
 
117 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 
125 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  66.04 
 
 
115 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  61.34 
 
 
130 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  55.86 
 
 
113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 
113 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  62.26 
 
 
113 aa  130  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  58.56 
 
 
113 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  60.55 
 
 
116 aa  129  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 
113 aa  127  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
113 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
126 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
113 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  61.32 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  60.38 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  55.65 
 
 
121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  61.26 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 
117 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  62.26 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  61.32 
 
 
115 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  59.43 
 
 
113 aa  123  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  50.86 
 
 
126 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  50.86 
 
 
126 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  59.43 
 
 
112 aa  123  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
128 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  49.17 
 
 
128 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
128 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
128 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  57.89 
 
 
139 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  60.38 
 
 
110 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  60.38 
 
 
110 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
120 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  59.43 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 
113 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  60 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>