More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0691 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  82.88 
 
 
112 aa  191  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf438  50S ribosomal protein L22  61.62 
 
 
210 aa  122  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  52.63 
 
 
122 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 
114 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  59.46 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  53.27 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
111 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
111 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  53.15 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  52.21 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  55.05 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 
111 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 
113 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  110  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 
110 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 
114 aa  110  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  110  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  52.78 
 
 
113 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  51.33 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  50.44 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
111 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  50 
 
 
136 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  50.47 
 
 
125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  50.48 
 
 
133 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  52.29 
 
 
110 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  50.47 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  45.22 
 
 
125 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  48.6 
 
 
110 aa  105  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 
113 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  48.67 
 
 
122 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 
117 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 
115 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.09 
 
 
110 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>