More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0772 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0772  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 118 aa  245  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.151637  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0494  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  37.27 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 111 aa  87  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 114 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  39.25 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  42.72 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  44.86 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  41.35 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  41.35 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  46 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  41.67 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  39.09 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  43.93 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  41.07 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  37.96 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  46.88 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  39.62 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  38.26 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  38.89 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>