More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0785 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  65.91 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  65.15 
 
 		 159 aa  189  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  68.42 
 
 		 149 aa  185  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  61.36 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  52.63 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  50 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  48.31 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  47.93 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  50.91 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  51.82 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  50.47 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  55.88 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  50 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  49.51 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  46.43 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  54 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  54 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  46.15 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  53 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  52.48 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  52.48 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>