More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0296 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  73.87 
 
 		 113 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  72.17 
 
 		 115 aa  169  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  73.87 
 
 		 113 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  73.91 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  72.17 
 
 		 114 aa  167  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 113 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  70.43 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  72.07 
 
 		 113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  70.09 
 
 		 117 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  70.09 
 
 		 117 aa  157  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  69.16 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  66.97 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  64.35 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  62.73 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  63.72 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  64.55 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  63.3 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  62.86 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  59.13 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  60.19 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  60 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  62.04 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  57.98 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  55.26 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  55.86 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  60.38 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  55.45 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  58.18 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  56.14 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  54.78 
 
 		 123 aa  120  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  55.14 
 
 		 212 aa  120  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  54.39 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  59.43 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  60 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  59.82 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  54.78 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  54.39 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  54.78 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  57 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  51.38 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  57 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  55.26 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  56.86 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2902  ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf438  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 210 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4908  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00527898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>