More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1280 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  100 
 
 
110 aa  216  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  79.44 
 
 
111 aa  176  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  60.95 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
110 aa  127  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  60.75 
 
 
110 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
110 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
111 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
115 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
115 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
110 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
113 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  55.14 
 
 
159 aa  117  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  59.05 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  55.56 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 
110 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  57.41 
 
 
116 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 
119 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 
111 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  55.34 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 
110 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  52.78 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  56 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  55.1 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  53.27 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  55.14 
 
 
111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  57.94 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  55.14 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  57.14 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  60.4 
 
 
110 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  54.21 
 
 
113 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  55.1 
 
 
110 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
117 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
117 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 
110 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  52.73 
 
 
112 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
110 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>