More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0986 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  100 
 
 
114 aa  228  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  59.63 
 
 
116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
159 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  54.46 
 
 
112 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 
113 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  52.63 
 
 
149 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  53.15 
 
 
113 aa  116  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  49.11 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 
114 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
113 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
117 aa  114  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
113 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
114 aa  110  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  51.79 
 
 
120 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  50.46 
 
 
136 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  51.4 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  47.32 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 
125 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 
117 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 
117 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  46.55 
 
 
122 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 
117 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 
125 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 
119 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 
120 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  44.64 
 
 
113 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  45.08 
 
 
125 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50 
 
 
110 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 
113 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  49.09 
 
 
111 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 
111 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
110 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  47.32 
 
 
136 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
118 aa  102  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  48.65 
 
 
113 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 
139 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 
119 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
110 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  49.04 
 
 
119 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  46.43 
 
 
112 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
110 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 
120 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 
120 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 
110 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
111 aa  100  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 
165 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 
120 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  45.76 
 
 
121 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 
140 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  52.29 
 
 
212 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  44.14 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  48.21 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2902  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  48.62 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  47.06 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  43.8 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  43.22 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  43.24 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  46.36 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>