More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1740 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  65.52 
 
 
118 aa  154  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  63.64 
 
 
111 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  61.68 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  61.47 
 
 
113 aa  133  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  61.47 
 
 
125 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  58.04 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  58.72 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
111 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  55.96 
 
 
110 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3662  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
128 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  51.72 
 
 
136 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
111 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
111 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  55.45 
 
 
116 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  53.21 
 
 
139 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  54.46 
 
 
142 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  54.46 
 
 
114 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  55.45 
 
 
113 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
117 aa  120  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  53.1 
 
 
136 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  55.86 
 
 
115 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 
111 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 
114 aa  120  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  49.58 
 
 
149 aa  120  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
113 aa  120  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
117 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
117 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
111 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  55.45 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  49.57 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 
125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
110 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
113 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
147 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  52.73 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
158 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
117 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  48.31 
 
 
149 aa  117  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 
113 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
113 aa  116  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 
110 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  55.66 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  56.31 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  53.21 
 
 
110 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.06 
 
 
110 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  52.94 
 
 
110 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
112 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  52.73 
 
 
113 aa  114  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  50.46 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  49.55 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  54.72 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  55.34 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  50.43 
 
 
122 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  48.31 
 
 
158 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 
139 aa  111  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 
110 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  51.38 
 
 
110 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  52.5 
 
 
197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  51.82 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  54.37 
 
 
110 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>