More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6044 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  89.36 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  75.68 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  71.43 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  70.18 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  66.4 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  71.56 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  73.33 
 
 		 152 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  73.33 
 
 		 152 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  68.55 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  68.18 
 
 		 117 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  69.16 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  66.04 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  71.82 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  73.64 
 
 		 197 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  68.97 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  60.8 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  60.66 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  63.16 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  70.91 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  70.91 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  70.91 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  64.81 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  66.07 
 
 		 281 aa  137  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  64.22 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  63.89 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  58.72 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  61.06 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  61.4 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  60 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  59.65 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  56.91 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  60.53 
 
 		 122 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  59.65 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  59.65 
 
 		 123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  61.4 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  61.47 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  58.54 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  62.04 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  59.62 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  56.59 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  59.63 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  59.43 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  59.63 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  60.95 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  59.26 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  58.72 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  58.65 
 
 		 121 aa  121  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  60.58 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  60.95 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  60.58 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  59.62 
 
 		 119 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  57.8 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  56.14 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  57.55 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  57.55 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  63.55 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  57.55 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>