More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3662 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3662  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  62.75 
 
 
118 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
120 aa  124  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  55.26 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  52.34 
 
 
110 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
125 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 
110 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
158 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  114  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
159 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  52.83 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  51.96 
 
 
159 aa  114  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  55 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  54.9 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
115 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  53.77 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  50.98 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  51.96 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  51.4 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  53 
 
 
113 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 
140 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  49.5 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  50.91 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  53.47 
 
 
110 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
111 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  47.27 
 
 
115 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  50 
 
 
110 aa  107  6e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 
111 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  45.28 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
110 aa  105  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
114 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  49.06 
 
 
139 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  49 
 
 
114 aa  104  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
114 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  49.02 
 
 
110 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  47.75 
 
 
120 aa  103  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  51.52 
 
 
115 aa  103  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
110 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 
111 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0426  50S ribosomal protein L22P  53.27 
 
 
110 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0842932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  51.89 
 
 
111 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  46.6 
 
 
113 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>