More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  75.21 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  74.56 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  74.34 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  73.45 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  72.57 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  69.91 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  68.1 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  69.23 
 
 		 126 aa  160  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  67.26 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  67.26 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  64.86 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  62.73 
 
 		 281 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  61.06 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  63.39 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  61.4 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  61.61 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  62.62 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  62.62 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  59.82 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  55.26 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  58.93 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  57.89 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  58.41 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0259  ribosomal protein L22  62.83 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1712  50S ribosomal protein L22  63.72 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.935527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  54.46 
 
 		 119 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  53.57 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  58.56 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  55.75 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  55.36 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  56.64 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  53.51 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  54.55 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  54.46 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  55.75 
 
 		 113 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  53.98 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  51.75 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  55.26 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  51.79 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  54.87 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  50.89 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  50.44 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>