More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0392 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 137 aa  276  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  78.52 
 
 		 135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  76.47 
 
 		 136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  65.25 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  60.53 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  65.79 
 
 		 116 aa  150  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  62.62 
 
 		 182 aa  149  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  63.89 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  65.45 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  54.7 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  50.86 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  51.33 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  50 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  51.52 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  50.51 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  50.51 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  47.71 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  51 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  46.73 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  46.6 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  51 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1495  hypothetical protein  60.66 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  41.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  42.15 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  45.19 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  46.46 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  46.46 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  40.77 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 136 aa  83.6  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  44.44 
 
 		 281 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  42 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  41.18 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  39.13 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  41.9 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  48.48 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  41.9 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>