More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3900 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  70.37 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  72.12 
 
 		 117 aa  153  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  66.36 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  72.12 
 
 		 152 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  72.12 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  65.85 
 
 		 281 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  67.31 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  63.64 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  68.57 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  66.98 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  60.66 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  63.89 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  58.06 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  61.34 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  62.04 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  54.76 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  57.39 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  60.18 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  58.93 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  58.93 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  57.27 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  60 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  59.22 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  58.87 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  59.22 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  54.72 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 110 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 114 aa  119  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  60.19 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.55 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  58.1 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  57.41 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  58.1 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  56.73 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  56.73 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  56.73 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  57.28 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  52.63 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 117 aa  116  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  56.31 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  54.81 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  56.31 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  53.27 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  52.34 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>