More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1018 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
177 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
177 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  99.44 
 
 
177 aa  344  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  83.85 
 
 
155 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  71.62 
 
 
197 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  83.2 
 
 
147 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  68.55 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  71.43 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  70.91 
 
 
140 aa  158  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  62.81 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  65.52 
 
 
142 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  66.97 
 
 
158 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  74.55 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  54.33 
 
 
139 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  66.35 
 
 
152 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  66.35 
 
 
152 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  62.86 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  58.02 
 
 
125 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  60 
 
 
114 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  62.26 
 
 
122 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  55.34 
 
 
117 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  61.11 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  56.07 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  51.67 
 
 
128 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  60.19 
 
 
119 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  51.55 
 
 
281 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  62.86 
 
 
113 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  53.98 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  51.26 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  59.09 
 
 
117 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  55 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  57.66 
 
 
126 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  62.26 
 
 
125 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  59.26 
 
 
118 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  58.25 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  58.25 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
128 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  54.47 
 
 
125 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
126 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
126 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  55.24 
 
 
119 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
120 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
128 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  60.19 
 
 
117 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 
111 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  59.81 
 
 
113 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  52.99 
 
 
122 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
113 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  52.94 
 
 
121 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
113 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  54.55 
 
 
122 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  53.39 
 
 
121 aa  120  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  52.1 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  59.26 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  58.88 
 
 
125 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  58.49 
 
 
120 aa  118  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 
121 aa  118  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  54.72 
 
 
125 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 
139 aa  118  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
111 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
111 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 
119 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  51.67 
 
 
123 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  58.1 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  51 
 
 
121 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
158 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  61.32 
 
 
130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  56.19 
 
 
120 aa  115  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 
129 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 
110 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  59.79 
 
 
110 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  56.48 
 
 
110 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 
110 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  59.05 
 
 
112 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  52.89 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  57.14 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  54.21 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  57.28 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  54.87 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  51 
 
 
122 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  57.28 
 
 
110 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  55.56 
 
 
115 aa  112  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  59.57 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  55.56 
 
 
113 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  59.57 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>