More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1645 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
128 aa  267  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  93.75 
 
 
128 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  93.75 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  85.16 
 
 
128 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  79.51 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  79.51 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  79.13 
 
 
121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  72.22 
 
 
129 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  79.44 
 
 
122 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  82.52 
 
 
121 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  67.27 
 
 
117 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  67.59 
 
 
119 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  65.45 
 
 
120 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  65.45 
 
 
120 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  61.02 
 
 
121 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  63.89 
 
 
119 aa  154  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  64.29 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  57.76 
 
 
119 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  51.3 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  50 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  50.43 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  50.45 
 
 
136 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18674  Plastid ribosomal protein L22 large ribosomal subunit  56.84 
 
 
101 aa  120  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034637  normal  0.692976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  50 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  50.47 
 
 
125 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  50.5 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  47.15 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  44.83 
 
 
158 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 
117 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
120 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 
125 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  49.02 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  49.02 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  49.17 
 
 
177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  49.17 
 
 
177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  46.02 
 
 
118 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  47.57 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  46.73 
 
 
113 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
155 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  49.5 
 
 
212 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 
114 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  48.57 
 
 
112 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
118 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  45.28 
 
 
114 aa  104  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 
117 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 
117 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  46.67 
 
 
125 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  51.02 
 
 
117 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  43.86 
 
 
120 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  48.6 
 
 
116 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  44.34 
 
 
115 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 
146 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  52.63 
 
 
110 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  44.55 
 
 
117 aa  100  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  48.98 
 
 
110 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  49.5 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  44.76 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  47.62 
 
 
113 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  44.66 
 
 
281 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  41.82 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  46.67 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  47.62 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  45.92 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  47.17 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43.81 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  47.12 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  40.91 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  48.45 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  45.87 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>