More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3157 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
182 aa  356  9e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  66.67 
 
 
130 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  56.25 
 
 
137 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  58.73 
 
 
135 aa  154  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  63.72 
 
 
136 aa  151  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  63.89 
 
 
119 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  59.26 
 
 
124 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  58.33 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 
117 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
119 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 
119 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 
119 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
118 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 
118 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  47.47 
 
 
119 aa  92.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1495  hypothetical protein  56.25 
 
 
94 aa  86.3  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  46.94 
 
 
120 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  46.15 
 
 
121 aa  84.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  45.05 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  43.56 
 
 
110 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  40.37 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  41.28 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 
111 aa  77.4  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  40.52 
 
 
141 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  45.36 
 
 
118 aa  77  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  41.12 
 
 
111 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  41.51 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  38.89 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  39.81 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  43.88 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  42.59 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  42.72 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  42.42 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  35.25 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  37.7 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  39.6 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  37.5 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  41.41 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  38.32 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  37.5 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  38.32 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  37.96 
 
 
114 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  39.81 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  39.62 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  39.62 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  38.61 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  42.42 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  41.51 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  41.51 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  37.11 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  37.96 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  41.84 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  40.95 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  41 
 
 
281 aa  71.2  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  40.57 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  40.57 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  37 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  40.57 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  40.57 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  40.4 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  41.84 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>