More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0186 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  90.35 
 
 		 118 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  84.87 
 
 		 119 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  84.87 
 
 		 119 aa  209  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  82.35 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  81.9 
 
 		 117 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  81.9 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  54.05 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  51.72 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  50.86 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  48.74 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  48.62 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 125 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  48.18 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  42.48 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  42.48 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  45.45 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  47.71 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  42.34 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  41.38 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  40.17 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  41.07 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  43.36 
 
 		 281 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  43.1 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  47.47 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  42.48 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  42.73 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  41.82 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>