More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0607 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  100 
 
 		 120 aa  245  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  65.81 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  67.86 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  72.57 
 
 		 119 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  65.25 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  66.07 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 116 aa  148  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  58.12 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  58.49 
 
 		 182 aa  136  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  48.74 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50.91 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  50 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  43.97 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  47.32 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1231  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677961  hitchhiker  0.000900157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  46.9 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  47.96 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  87.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  45.13 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  46.36 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  42.86 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  46.02 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  45.1 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  45.1 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>