More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0479 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0479  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.867653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_422  ribosomal protein L22  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000272557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0456  50S ribosomal protein L22  98.17 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000579396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  49.54 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0631  ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000531978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4543  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0459  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292472  unclonable  0.00000017309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5074  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000267076  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0842  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4744  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00307262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3904  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08900  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0235931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0489  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0492  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379964  normal  0.101974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  48.94 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  50.52 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  51.55 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  51.55 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  52.13 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  51.55 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  51.06 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0499  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00322381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 111 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  45.61 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0438  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00481057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  44.64 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  47.22 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 113 aa  95.9  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  46.81 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  49.48 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  49.48 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  44.04 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  48.42 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  47.52 
 
 		 133 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  49.48 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  43.86 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  45.87 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  46.88 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>