More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2147 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2147  recombination protein RecR  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0187  recombination protein RecR  73 
 
 		 201 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.957201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2271  recombination protein RecR  69 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0068  DNA replication and repair protein RecR  70.71 
 
 		 198 aa  277  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0196  recombination protein RecR  55 
 
 		 201 aa  244  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0508  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  39.09 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  34.01 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  36.82 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0032  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000244009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  39.09 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  33.67 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  36.46 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  35.38 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  33.16 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  34.54 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  37.93 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  33.16 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  34.54 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  34.01 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  34.01 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  36.6 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  34.52 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  32.65 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  34.02 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  38.92 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  38.92 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  39.27 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  37 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  39.27 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  38.42 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  36.73 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  37.11 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  34.55 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  36.08 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  32.49 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  37.44 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  37.95 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  35.38 
 
 		 197 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  35.6 
 
 		 189 aa  140  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  37 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  35.38 
 
 		 197 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  32.16 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  34.8 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  36.46 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  35.23 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  33.5 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  35.42 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  37.95 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  37.5 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  31.98 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  37.24 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  34.01 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  36.6 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  32.65 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  41.27 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  34.34 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  37.63 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  34.03 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  35.57 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  33.15 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  31.47 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  31.41 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  31.47 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  39.6 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  38.61 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  38.46 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  37.5 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  37.11 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  30.96 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  33.85 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  35.94 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  36.27 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  33.33 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  31.79 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  38.02 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  32.62 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  32.07 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  38.02 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  35.57 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  32.07 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0664  recombination protein RecR  31.12 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  31.44 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  36.98 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>