More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0032 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0032  recombination protein RecR  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000244009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  53.54 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  47.47 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  51.03 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  51.3 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  47.69 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  48.42 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  45.45 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  45.45 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  44.23 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  46.97 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  48.63 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  47.8 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  45.79 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  46.03 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  43.43 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  44.22 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  45.5 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  46.46 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  44.74 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  46.11 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0187  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.957201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1533  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  41.54 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>