More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0277 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  69.15 
 
 		 201 aa  309  2.9999999999999997e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  65.67 
 
 		 198 aa  281  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  65.17 
 
 		 198 aa  280  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  66.17 
 
 		 199 aa  278  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 198 aa  278  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  62.69 
 
 		 198 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  61.69 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  62.19 
 
 		 198 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  62.19 
 
 		 198 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  59.2 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  59.7 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  58.79 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  54.77 
 
 		 198 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  54.27 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  51.76 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  52.74 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  53.77 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  50.5 
 
 		 200 aa  218  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  52.02 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  51.26 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 198 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 198 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  49.75 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  51.23 
 
 		 201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 199 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  51.52 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  49.25 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  51.26 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  47.24 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  49.75 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  47.76 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  49.49 
 
 		 199 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.8 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  48.02 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  49.75 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 199 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 199 aa  197  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  49.49 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  48.73 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  47.96 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  46.27 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  48.22 
 
 		 204 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  45.54 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  46.43 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  46.19 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  45.45 
 
 		 205 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 198 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 198 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  45.77 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  45.77 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  48.98 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  45.92 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  43.28 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  42.79 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.79 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  44.72 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  43.84 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  46.94 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  43.84 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  46.77 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  46.35 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  43.84 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>