More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3658 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3658  glucose transport system permease protein  100 
 
 
372 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
374 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
374 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
383 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
323 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
330 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
330 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
335 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
306 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
307 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.66 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  50 
 
 
295 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.52 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  28.65 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  28.65 
 
 
310 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
302 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 
317 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 
317 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.46 
 
 
298 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  41.33 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  44.93 
 
 
299 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
309 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
309 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
295 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
312 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.13 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968646  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.36 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.36 
 
 
302 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  44.36 
 
 
302 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
302 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
312 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
312 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
293 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
292 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
292 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
298 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
302 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
302 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
302 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
302 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  38.36 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.13 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  38.36 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  38.36 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  37.65 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  38.36 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  38.36 
 
 
312 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  37.74 
 
 
357 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
294 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.15 
 
 
289 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
292 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
302 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
299 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
299 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
359 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  25.48 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06330  carbohydrate ABC transporter membrane protein  24.79 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
309 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3957  sugar transport system (permease)  29.14 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225692  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.16 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.81 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.71 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
301 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
301 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  41.13 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
291 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
439 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>