More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6731 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
337 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.88 
 
 
359 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06330  carbohydrate ABC transporter membrane protein  57.01 
 
 
368 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  54.03 
 
 
350 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.19 
 
 
372 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3957  sugar transport system (permease)  51.84 
 
 
365 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225692  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
299 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
310 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
295 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.56 
 
 
301 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
417 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
402 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
299 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
415 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  32.02 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
317 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
353 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
382 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.48 
 
 
320 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
295 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
305 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
293 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  33.54 
 
 
293 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
316 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
302 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
300 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
316 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
298 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
294 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.61 
 
 
314 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
291 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
306 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
308 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
307 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
299 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  31.06 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
305 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
314 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
307 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
318 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
318 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
317 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.91 
 
 
317 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
316 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
298 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
307 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
315 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
316 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
312 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772545  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
316 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  32.73 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2645  oligogalacturonide ABC tansporter, permease  32.92 
 
 
296 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.952468  normal  0.0439933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  31.93 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
306 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
366 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0908465  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
320 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1691  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  32.92 
 
 
296 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.041328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
309 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
364 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.32396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
296 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
293 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.44 
 
 
314 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  31.44 
 
 
314 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
319 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.491906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
318 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
314 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
429 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
294 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5821  sugar ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
315 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.42 
 
 
287 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
290 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
317 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
313 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12339  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspA  32.94 
 
 
290 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  31.12 
 
 
306 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
294 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
303 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
314 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
292 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
318 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  0.0165665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
420 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>