69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0421 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  100 
 
 		 611 aa  1245    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  45.93 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.38 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 239 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 227 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.85 
 
 		 243 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.02 
 
 		 241 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.1 
 
 		 252 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.73 
 
 		 244 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.9 
 
 		 246 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.34 
 
 		 256 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  27.9 
 
 		 242 aa  97.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  27.13 
 
 		 267 aa  97.1  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.9 
 
 		 231 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.43 
 
 		 261 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 225 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.92 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.27 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.17 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.36 
 
 		 353 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.49 
 
 		 242 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.02 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  28.77 
 
 		 675 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  23.11 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2965  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.17 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1399  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.17 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.52 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.72 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.88 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  25.59 
 
 		 324 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.25 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  23.39 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  23.39 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  28.57 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  28.57 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  31.84 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.97 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  24.49 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.44 
 
 		 224 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.51 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.62 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.14 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.01 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  26.6 
 
 		 525 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  31.89 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  22.88 
 
 		 876 aa  55.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  27.84 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.08 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 574 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.74 
 
 		 356 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.01 
 
 		 344 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  27.78 
 
 		 652 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  24.04 
 
 		 354 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.17 
 
 		 241 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.47 
 
 		 357 aa  47.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1291  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  19.78 
 
 		 327 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  24.54 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  28.81 
 
 		 362 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1970  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 312 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.750902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  28.8 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  22.43 
 
 		 342 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  27.76 
 
 		 500 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>