84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01580  spore coat polysaccharide biosynthesis protein F, CMP-KDO synthetase  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0275127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1198  acylneuraminate cytidylyltransferase  50 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1966  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.39 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.333673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0583  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.15 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3211  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.65 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2230  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.81 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1771  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.3 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0135  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000052261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1973  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.49 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0677  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.59 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.748582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2891  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.25 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.022912 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0093  hypothetical protein  32.92 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3112  acylneuraminate cytidylyltransferase  32 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0776  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.38 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.885113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0201  hypothetical protein  32.79 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0645  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.68 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1245  aminotransferase  31.82 
 
 		 675 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0340  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1201  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.47 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.77 
 
 		 593 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0092  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  27.97 
 
 		 682 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1893  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.74 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0366  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 453 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592907  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.89 
 
 		 611 aa  95.5  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2634  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.41 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0413  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.31 
 
 		 225 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3727  acylneuraminate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.23 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3679  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  26.74 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2366  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.2 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0289371  hitchhiker  0.00290087 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14261  hypothetical protein  27.98 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3732  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.62 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1137  polysaccharide biosynthesis protein, CMP-KDO synthetase-like  36.61 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  31.89 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16990  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.21 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1721  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsF, putative  24.28 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128501  hitchhiker  0.000000384945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4298  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.67 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2209  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.86 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.441808  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0248  acylneuraminate cytidylyltransferase  30 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0063  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.78 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  24.8 
 
 		 876 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1639  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.81 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0014  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0032513  normal  0.963586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1725  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0245975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 574 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1759  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183972  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1466  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  34.43 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3269  cytidyltransferase-like protein  23.94 
 
 		 574 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2134  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000481379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4332  acylneuraminate cytidylyltransferase  48.05 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1393  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.07 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2299  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  36.88 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268652  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0807949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01538  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.9 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  47.22 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000979524  decreased coverage  0.0000842589 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0732  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.51 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2324  acylneuraminate cytidylyltransferase  42.65 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2821  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35.04 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2375  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.79 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000365007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2363  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.79 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1984  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.79 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000339206  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5734  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.67 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1866  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.39 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2128  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  42.25 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1160  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  34.46 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0727  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0216  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2424  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000116864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2752  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  34.69 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0149  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.2 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000175858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3575  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  36.92 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1314  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1851  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000189407  hitchhiker  0.000000640943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2127  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0160817  unclonable  0.0000196701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1906  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 245 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007413  unclonable  0.0000000000750145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2582  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  30.51 
 
 		 242 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2845  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  40 
 
 		 250 aa  42  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2478  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 245 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2800  3-deoxy-D-manno- octulosonatecytidylyltransferase  29.84 
 
 		 252 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4894  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  33.77 
 
 		 272 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1844  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 254 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0634  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 228 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.684247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>