56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1892 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  69.07 
 
 		 544 aa  792    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  100 
 
 		 652 aa  1325    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  58.42 
 
 		 543 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.11 
 
 		 548 aa  211  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  33.43 
 
 		 345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 		 322 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  24.55 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  25.72 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  24 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  25.25 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.75 
 
 		 593 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  26.65 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  22.12 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  28.97 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  28.97 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  26.78 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.67 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.65 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  24.05 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  24.33 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  23.53 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  23.42 
 
 		 342 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  20.9 
 
 		 373 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1972  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  26.72 
 
 		 235 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.338382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.36 
 
 		 367 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  26.12 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  27.85 
 
 		 611 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.65 
 
 		 344 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.82 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3990  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  22.69 
 
 		 243 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.49 
 
 		 243 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.55 
 
 		 229 aa  48.5  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28 
 
 		 225 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  25.28 
 
 		 337 aa  48.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.45 
 
 		 225 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  26.22 
 
 		 346 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3365  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.6 
 
 		 244 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.41 
 
 		 349 aa  47.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35.82 
 
 		 262 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  29.75 
 
 		 239 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.34 
 
 		 227 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1455  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.97 
 
 		 240 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.65 
 
 		 229 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0443  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.9 
 
 		 256 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.49 
 
 		 221 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.11 
 
 		 230 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.07 
 
 		 231 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.07 
 
 		 231 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0599  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.67 
 
 		 238 aa  43.9  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 241 aa  43.9  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>