70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2633 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  100 
 
 
544 aa  1108    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  69.07 
 
 
652 aa  790    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  61.99 
 
 
543 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.52 
 
 
548 aa  220  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  33.43 
 
 
345 aa  110  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  27.22 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  27.27 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  28.57 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  28.62 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
399 aa  77  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  30.84 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  30.84 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  25.08 
 
 
331 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.43 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  29.07 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1972  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  27.07 
 
 
235 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.338382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  29.68 
 
 
387 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  24.72 
 
 
569 aa  65.1  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
343 aa  63.9  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  21.66 
 
 
366 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  22.71 
 
 
525 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.23 
 
 
229 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  22.93 
 
 
342 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  21.89 
 
 
367 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  20.63 
 
 
285 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.57 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 
491 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.62 
 
 
229 aa  53.9  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1024  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.42 
 
 
229 aa  53.9  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.2 
 
 
233 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.86 
 
 
221 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
500 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.11 
 
 
611 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.67 
 
 
230 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1484  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.13 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.51038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  23.2 
 
 
349 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.87 
 
 
232 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.46 
 
 
231 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.46 
 
 
231 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1514  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.63 
 
 
233 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3990  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.27 
 
 
243 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.34 
 
 
233 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4941  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 
230 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0364  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.65 
 
 
234 aa  47  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  25.86 
 
 
230 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.06 
 
 
227 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3562  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.69 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.298178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0443  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.27 
 
 
256 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2336  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.51 
 
 
232 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177119  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0021  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.75 
 
 
233 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.05 
 
 
344 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  30.89 
 
 
239 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  24.02 
 
 
356 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1578  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.81 
 
 
232 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  32.05 
 
 
262 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.31 
 
 
230 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.89 
 
 
243 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  25.9 
 
 
337 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.54 
 
 
235 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1549  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.04 
 
 
225 aa  44.3  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.9 
 
 
357 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1455  acylneuraminate cytidylyltransferase  25 
 
 
240 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.5 
 
 
241 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0706  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.65 
 
 
182 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3094  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.88 
 
 
226 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0378  posttranslational flagellin modification protein B  24.2 
 
 
235 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0559  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.95 
 
 
229 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>