36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2211 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  46.91 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  48.74 
 
 
274 aa  248  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  48.34 
 
 
274 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  49.08 
 
 
274 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  49.08 
 
 
274 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.34 
 
 
357 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  26.81 
 
 
366 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
525 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
502 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  27.49 
 
 
349 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  28.43 
 
 
371 aa  99.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
399 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  26.77 
 
 
367 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  28.38 
 
 
354 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
500 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.06 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  28.42 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  25.53 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
497 aa  75.5  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.92 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  25 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  24.32 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  24.51 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  25.78 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.48 
 
 
593 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  20.63 
 
 
544 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.27 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  24.87 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.66 
 
 
611 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  26.67 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0482477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  24.2 
 
 
346 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  25 
 
 
342 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>