35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1321 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  100 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  75.74 
 
 		 274 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  75.74 
 
 		 274 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  74.63 
 
 		 274 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  52.38 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  48.74 
 
 		 285 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  29.35 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 399 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  29.02 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  27.3 
 
 		 353 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  33.85 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  28.42 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  25.25 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  25.52 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  27.36 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  28.3 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.6 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  25.17 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  27.8 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  31.53 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.4 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.02 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  21.79 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  26.62 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  24.4 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.9 
 
 		 593 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  22.5 
 
 		 348 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  22.5 
 
 		 348 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0645  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  20.63 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  23.87 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0482477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>