48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0657 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 349 aa  714    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  46.78 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  45.4 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  44.48 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 		 525 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  41.75 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  38.42 
 
 		 497 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  39.73 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  35.41 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  36.24 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  31.64 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  33.76 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  28.69 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  31.7 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  28.16 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  25.64 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.48 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  27.57 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.66 
 
 		 548 aa  85.9  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  26.42 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  30.32 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  29.24 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  28.38 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  28.38 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  25.86 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  25.86 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  24.85 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  28.25 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  24.27 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  27.62 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  26.89 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  28.02 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  25.24 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.13 
 
 		 593 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  26.13 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  27.88 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 611 aa  57  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  26.89 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3115  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  29.87 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  28.26 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  19.29 
 
 		 569 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  27.34 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0482477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>