60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2211 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  100 
 
 
543 aa  1113    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  58.59 
 
 
652 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  61.99 
 
 
544 aa  667    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.33 
 
 
548 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  33.33 
 
 
345 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
322 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  30.54 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  30.54 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.63 
 
 
593 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  24.37 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  24.11 
 
 
354 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
502 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  22.95 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  24.42 
 
 
316 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.41 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  27.12 
 
 
362 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 
343 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  24.68 
 
 
349 aa  62.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  24.63 
 
 
569 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  27.34 
 
 
353 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  26.44 
 
 
353 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  25.75 
 
 
387 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
349 aa  57.4  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  25.49 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1972  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  31.39 
 
 
235 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.338382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.03 
 
 
239 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3115  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  30.88 
 
 
233 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
525 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
399 aa  53.9  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0573  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  35.9 
 
 
262 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  22.03 
 
 
367 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  22.18 
 
 
371 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.02 
 
 
229 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.4 
 
 
611 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.38 
 
 
232 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0534  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.77 
 
 
234 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  23.73 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3078  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.67 
 
 
233 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.82 
 
 
230 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.08 
 
 
227 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  22.07 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0009  putative transferase  25.87 
 
 
383 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.848658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.01 
 
 
233 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0443  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.14 
 
 
256 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1520  posttranslational flagellin modification protein B  23.85 
 
 
235 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07300  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.34 
 
 
227 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  25.46 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  21.52 
 
 
500 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.93 
 
 
233 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3104  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25 
 
 
233 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.37 
 
 
243 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2210  pseudaminic acid CMP-transferase  27.54 
 
 
232 aa  44.3  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.2 
 
 
225 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0378  posttranslational flagellin modification protein B  23.08 
 
 
235 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.09 
 
 
221 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1229  flagellin modification protein PtmB, acylneuraminate cytidylyltransferase  24.03 
 
 
235 aa  43.5  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1158  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase NeuA  26.76 
 
 
413 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.2 
 
 
225 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  26.09 
 
 
611 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>