31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3728 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  100 
 
 		 316 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  44.63 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  27.55 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  28.57 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  25.67 
 
 		 502 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  26.91 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  25.72 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  24.12 
 
 		 543 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  22.89 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.49 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.67 
 
 		 593 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  22.88 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.48 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  27.31 
 
 		 491 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  27.36 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.29 
 
 		 367 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  27.55 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  21.18 
 
 		 569 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  19.81 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  30.72 
 
 		 348 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  30.72 
 
 		 348 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  24.81 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 		 500 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  26.37 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  26.02 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  24.76 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  20.75 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.15 
 
 		 611 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>