69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1522 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
500 aa  1011    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  53.01 
 
 
491 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  31.97 
 
 
366 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  37.39 
 
 
357 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  35.18 
 
 
359 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.34 
 
 
399 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  33.88 
 
 
367 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
502 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  34.46 
 
 
349 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
525 aa  170  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  32.87 
 
 
371 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 
349 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  32.61 
 
 
353 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  30.37 
 
 
353 aa  143  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  25.86 
 
 
354 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  27.47 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 
343 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  31.25 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  28.69 
 
 
331 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  29.62 
 
 
349 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  28.06 
 
 
362 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  31.22 
 
 
348 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  31.22 
 
 
348 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  25.57 
 
 
291 aa  93.6  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  25.42 
 
 
274 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  25 
 
 
285 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  25.42 
 
 
274 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  26.83 
 
 
337 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  23.75 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 
593 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  24.93 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  24.42 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1970  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  27.76 
 
 
312 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.750902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  26.89 
 
 
331 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0482477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.45 
 
 
548 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  22.89 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.77 
 
 
356 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  22.64 
 
 
344 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3115  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  26.47 
 
 
233 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1892  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.79 
 
 
652 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.39 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  25.43 
 
 
345 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
322 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  32.88 
 
 
907 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0645  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  25.94 
 
 
322 aa  53.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2633  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  27.5 
 
 
544 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  20.78 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0421  spore coat polysaccharide biosynthesis protein FlmC  27.5 
 
 
611 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  25.15 
 
 
342 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  33.09 
 
 
976 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  32.03 
 
 
902 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  31.43 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1291  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  20.38 
 
 
327 aa  47  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0675  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.22 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3028  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  23.57 
 
 
172 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3683  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.663292  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  25.23 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 
899 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2797  acetyltransferase  26.85 
 
 
180 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00286655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
821 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.43 
 
 
831 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  25.5 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  25.5 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  25.5 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000295975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.45 
 
 
909 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  21.52 
 
 
543 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2533  acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000193156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
181 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>