51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2626 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2626  FlaR protein (FlaR)  100 
 
 		 371 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1722  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  38.66 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.000000995327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0585  Glycosyltransferase 28 domain protein  38.33 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3209  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  36.9 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1246  surface polysaccharide biosynthesis protein, transferase  34.44 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2325  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.98 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 500 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3096  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 		 497 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  34.37 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3708  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3029  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  34.16 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2095  putative flagellin modification protein FlmD  31.4 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1283  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0657  polysaccharide biosynthesis protein  33.76 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.140492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2222  glycosyltransferase 28-like protein  28.37 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1967  flagellin modification protein FlmD  28.57 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.979737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0775  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 502 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.736267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4299  flagellin modification protein FlmD  30.97 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0212  glycosyltransferase  27.09 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1777  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  26.01 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2211  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  28.43 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3563  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  26.01 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  0.902777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2427  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  26.96 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.506517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0563  putative flagellar protein  24.27 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1136  polysaccharide biosynthesis protein, glycosyltransferase  25.58 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1507  flagellar protein, putative  28.48 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1329  flagellar protein, putative  28.48 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1321  nucleotidase specific for PseC product, UDP-4-amino-4,6-dideoxy-beta-L-AltNAc  31.53 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165728  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3551  flagellin modification protein FlmD  24.72 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288213  normal  0.478798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0088  flagellin modification protein FlmD  24.72 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0402  putative flagellar protein  26.47 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.537873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4265  pseudaminic acid biosynthesis-associated protein PseG  23.41 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.514785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3944  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  24.04 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13692  normal  0.0702368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3075  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  24.04 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2760  polysaccharide biosynthesis protein; glycosyltransferase  23.28 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1331  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like  23.73 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0454  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.29 
 
 		 593 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1970  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  24.46 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.750902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0414  putative glycosyltransferase spore coat polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407624  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.73 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01590  spore coat polysaccharide biosynthesis protein, predicted glycosyltransferase  22.85 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0482477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2211  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  22.53 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0616  acylneuraminate cytidylyltransferase  24 
 
 		 611 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0678473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2368  cytidine 5'monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase  24.71 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.275161  hitchhiker  0.00639534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  28.16 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1291  spore coat polysaccharide biosynthesis protein glycosyltransferase-like protein  22.46 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3728  putative spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase  26.37 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1389  hypothetical protein  22.17 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  23.44 
 
 		 569 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0645  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  27.97 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>